Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARD11Q9BXL7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARD11Q9BXL7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARD11Q9BXL7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARD11Q9BXL7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms