Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms