Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SGIP1Q9BQI5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SGIP1Q9BQI5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
SGIP1Q9BQI5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms