Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDRT15Q96T59 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDRT15Q96T59 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT15Q96T59 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms