Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERGIC2Q96RQ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERGIC2Q96RQ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERGIC2Q96RQ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms