Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNC2Q96PR1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNC2Q96PR1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms