Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRD1AQ96P16 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPRD1AQ96P16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms