Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
COG3Q96JB2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms