Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL26A1Q96A83 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL26A1Q96A83 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms