Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIT1Q92963 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIT1Q92963 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms