Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CSRNP3Q8WYN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CSRNP3Q8WYN3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms