Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms