Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC9Q8TBE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FNDC9Q8TBE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms