Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms