Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL3Q8IZI9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFNL3Q8IZI9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFNL3Q8IZI9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNL3Q8IZI9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms