Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACE1Q8IYU2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACE1Q8IYU2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms