Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHERPQ8IWX8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms