Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
YTHDF3Q7Z739 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms