Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC141Q6ZP82 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC141Q6ZP82 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms