Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN1Q6NZI2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms