Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFCAB12Q6NXP0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFCAB12Q6NXP0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms