Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP4R4Q6NUP7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms