Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFAP70Q5T0N1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP70Q5T0N1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFAP70Q5T0N1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CFAP70Q5T0N1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms