Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms