Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNI3KQ59H18 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI3KQ59H18 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms