Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRD12Q587J7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRD12Q587J7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms