Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCD4Q53EL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD4Q53EL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms