Protein–RNA interactions for Protein: Q494X3

ZNF404, Zinc finger protein 404, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404Q494X3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF404Q494X3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF404Q494X3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF404Q494X3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms