Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL19A1Q14993 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL19A1Q14993 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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