Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK13Q14004 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CDK13Q14004 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CDK13Q14004 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CDK13Q14004 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
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