Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4AQ13619 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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