Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX1T1Q06455 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX1T1Q06455 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms