Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDSRQ06136 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDSRQ06136 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms