Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms