Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX1Q04741 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms