Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX2Q02962 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms