Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP3Q02447 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP3Q02447 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SP3Q02447 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP3Q02447 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP3Q02447 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SP3Q02447 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP3Q02447 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP3Q02447 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP3Q02447 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP3Q02447 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP3Q02447 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP3Q02447 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP3Q02447 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP3Q02447 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP3Q02447 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP3Q02447 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP3Q02447 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP3Q02447 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SP3Q02447 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP3Q02447 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SP3Q02447 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP3Q02447 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP3Q02447 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP3Q02447 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP3Q02447 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SP3Q02447 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP3Q02447 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP3Q02447 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP3Q02447 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP3Q02447 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP3Q02447 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP3Q02447 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SP3Q02447 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SP3Q02447 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SP3Q02447 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP3Q02447 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP3Q02447 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP3Q02447 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP3Q02447 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP3Q02447 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP3Q02447 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP3Q02447 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP3Q02447 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP3Q02447 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP3Q02447 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP3Q02447 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP3Q02447 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP3Q02447 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP3Q02447 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP3Q02447 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP3Q02447 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP3Q02447 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP3Q02447 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP3Q02447 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SP3Q02447 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP3Q02447 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP3Q02447 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP3Q02447 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP3Q02447 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP3Q02447 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SP3Q02447 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SP3Q02447 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP3Q02447 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP3Q02447 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP3Q02447 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP3Q02447 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP3Q02447 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP3Q02447 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP3Q02447 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP3Q02447 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SP3Q02447 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP3Q02447 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SP3Q02447 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP3Q02447 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP3Q02447 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP3Q02447 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP3Q02447 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP3Q02447 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP3Q02447 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP3Q02447 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP3Q02447 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP3Q02447 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP3Q02447 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms