Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX1P78414 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX1P78414 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX1P78414 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX1P78414 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX1P78414 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX1P78414 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX1P78414 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX1P78414 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX1P78414 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX1P78414 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX1P78414 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX1P78414 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX1P78414 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX1P78414 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX1P78414 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX1P78414 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX1P78414 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX1P78414 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX1P78414 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX1P78414 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX1P78414 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX1P78414 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX1P78414 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX1P78414 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX1P78414 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX1P78414 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX1P78414 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX1P78414 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms