Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A1P68400 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms