Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM4P67936 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM4P67936 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM4P67936 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM4P67936 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM4P67936 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPM4P67936 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM4P67936 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM4P67936 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM4P67936 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM4P67936 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM4P67936 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM4P67936 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM4P67936 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM4P67936 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM4P67936 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM4P67936 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM4P67936 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM4P67936 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM4P67936 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM4P67936 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM4P67936 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM4P67936 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM4P67936 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM4P67936 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM4P67936 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM4P67936 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM4P67936 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM4P67936 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM4P67936 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM4P67936 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM4P67936 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM4P67936 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM4P67936 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM4P67936 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM4P67936 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM4P67936 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM4P67936 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM4P67936 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM4P67936 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM4P67936 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM4P67936 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM4P67936 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM4P67936 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM4P67936 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM4P67936 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM4P67936 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM4P67936 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM4P67936 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM4P67936 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM4P67936 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TPM4P67936 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM4P67936 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPM4P67936 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPM4P67936 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPM4P67936 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM4P67936 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms