Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GNB1P62873 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GNB1P62873 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB1P62873 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB1P62873 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB1P62873 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB1P62873 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB1P62873 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GNB1P62873 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB1P62873 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB1P62873 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB1P62873 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB1P62873 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GNB1P62873 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB1P62873 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB1P62873 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB1P62873 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB1P62873 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB1P62873 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB1P62873 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB1P62873 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB1P62873 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB1P62873 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB1P62873 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB1P62873 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB1P62873 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB1P62873 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB1P62873 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNB1P62873 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNB1P62873 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNB1P62873 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB1P62873 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB1P62873 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB1P62873 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB1P62873 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB1P62873 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB1P62873 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB1P62873 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB1P62873 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB1P62873 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB1P62873 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB1P62873 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB1P62873 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB1P62873 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB1P62873 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB1P62873 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms