Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CASP7P55210 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP7P55210 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP7P55210 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP7P55210 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP7P55210 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP7P55210 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP7P55210 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASP7P55210 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASP7P55210 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASP7P55210 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASP7P55210 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASP7P55210 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASP7P55210 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASP7P55210 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP7P55210 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP7P55210 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP7P55210 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP7P55210 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP7P55210 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP7P55210 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CASP7P55210 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CASP7P55210 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CASP7P55210 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP7P55210 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP7P55210 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP7P55210 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP7P55210 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP7P55210 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP7P55210 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP7P55210 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CASP7P55210 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP7P55210 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP7P55210 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP7P55210 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP7P55210 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP7P55210 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP7P55210 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP7P55210 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP7P55210 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP7P55210 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP7P55210 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP7P55210 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP7P55210 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP7P55210 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP7P55210 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASP7P55210 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASP7P55210 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASP7P55210 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASP7P55210 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP7P55210 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP7P55210 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP7P55210 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASP7P55210 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASP7P55210 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CASP7P55210 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CASP7P55210 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CASP7P55210 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CASP7P55210 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASP7P55210 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASP7P55210 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASP7P55210 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASP7P55210 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASP7P55210 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP7P55210 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP7P55210 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP7P55210 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP7P55210 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASP7P55210 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASP7P55210 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP7P55210 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP7P55210 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP7P55210 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP7P55210 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP7P55210 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP7P55210 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP7P55210 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP7P55210 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP7P55210 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP7P55210 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP7P55210 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP7P55210 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP7P55210 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP7P55210 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP7P55210 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms