Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP11P51784 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP11P51784 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP11P51784 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP11P51784 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP11P51784 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP11P51784 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP11P51784 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP11P51784 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP11P51784 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP11P51784 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP11P51784 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP11P51784 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP11P51784 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP11P51784 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP11P51784 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP11P51784 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP11P51784 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP11P51784 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP11P51784 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP11P51784 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP11P51784 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP11P51784 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP11P51784 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP11P51784 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP11P51784 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP11P51784 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP11P51784 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP11P51784 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP11P51784 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP11P51784 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP11P51784 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP11P51784 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP11P51784 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP11P51784 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP11P51784 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP11P51784 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP11P51784 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP11P51784 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP11P51784 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP11P51784 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP11P51784 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP11P51784 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP11P51784 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP11P51784 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP11P51784 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP11P51784 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP11P51784 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP11P51784 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP11P51784 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP11P51784 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP11P51784 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP11P51784 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP11P51784 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP11P51784 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP11P51784 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP11P51784 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP11P51784 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP11P51784 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP11P51784 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP11P51784 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP11P51784 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP11P51784 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP11P51784 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP11P51784 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP11P51784 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP11P51784 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP11P51784 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP11P51784 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP11P51784 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP11P51784 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP11P51784 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP11P51784 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP11P51784 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP11P51784 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP11P51784 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP11P51784 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP11P51784 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP11P51784 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP11P51784 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms