Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5CP51148 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB5CP51148 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.2 ms