Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPINT3P49223 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINT3P49223 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPINT3P49223 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms