Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF4P48230 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF4P48230 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms