Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA2P48052 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA2P48052 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPA2P48052 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA2P48052 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA2P48052 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA2P48052 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA2P48052 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA2P48052 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA2P48052 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA2P48052 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA2P48052 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA2P48052 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA2P48052 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA2P48052 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA2P48052 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA2P48052 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA2P48052 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA2P48052 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA2P48052 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA2P48052 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA2P48052 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA2P48052 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA2P48052 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA2P48052 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA2P48052 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA2P48052 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA2P48052 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA2P48052 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA2P48052 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA2P48052 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA2P48052 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA2P48052 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA2P48052 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA2P48052 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA2P48052 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA2P48052 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA2P48052 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA2P48052 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA2P48052 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA2P48052 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA2P48052 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA2P48052 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA2P48052 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA2P48052 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA2P48052 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPA2P48052 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms