Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABIFP47224 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABIFP47224 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABIFP47224 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RABIFP47224 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABIFP47224 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABIFP47224 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABIFP47224 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABIFP47224 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RABIFP47224 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABIFP47224 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABIFP47224 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABIFP47224 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABIFP47224 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABIFP47224 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABIFP47224 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABIFP47224 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABIFP47224 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABIFP47224 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABIFP47224 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RABIFP47224 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABIFP47224 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABIFP47224 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABIFP47224 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABIFP47224 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABIFP47224 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABIFP47224 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABIFP47224 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABIFP47224 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RABIFP47224 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABIFP47224 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABIFP47224 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABIFP47224 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABIFP47224 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABIFP47224 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABIFP47224 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms