Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTRLP40313 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTRLP40313 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTRLP40313 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTRLP40313 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTRLP40313 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTRLP40313 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTRLP40313 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CTRLP40313 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTRLP40313 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTRLP40313 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTRLP40313 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTRLP40313 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTRLP40313 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTRLP40313 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTRLP40313 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTRLP40313 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTRLP40313 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTRLP40313 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTRLP40313 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms