Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASQ1P31415 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASQ1P31415 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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